期刊简介
1985年创刊，中华医学会主办。本刊是反映我国当代及与国外合作的，在内分泌代谢病学领域内临床与科研最新成果的高级学术刊物。在强调刊文的先进性、科学性与新颖性的同时，也十分重视临床的实用性和论文的可读性。本刊设指南与共识、述评、专论、论坛、临床研究、基础研究、综述、讲座、临诊应对、当年学术进展与动态、临床经验交流、新药研究、学术争鸣及国外期刊论文评论等栏目。本刊的读者对象主要为各级从事临床和基础内分泌代谢病学工作的医、教、研人员及研究生，以及内、外、儿、妇科以及神经、泌尿、老年、营养等相关科室的人员。
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首页>中华内分泌代谢杂志
- 杂志名称：中华内分泌代谢杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1000-6699
- 国内刊号：31-1282/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：92年12月获中华医学会华瑞杯优秀期刊三等奖期刊收录：CA 化学文摘(美), 维普收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 万方收录(中), 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
构建人类胰岛基因共表达网络鉴定2型糖尿病重要分子
王亮歌；施劲松
关键词：糖尿病, 2型, 胰岛, 转录组, 共表达网络, 模块, 枢纽基因
摘要：目的 利用胰岛转录组数据构建共表达网络,鉴定与2型糖尿病发病相关的重基因及其作用机制.方法 从NCBI的GEO数据库中下载芯片数据GSE38642,包括2型糖尿病样本9例、糖尿病前期样本9例(6%≤HbA1C<6.5%)、正常对照样本31例(HbA1C<6%).用R语言权重基因共表达网络分析( weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)包构建基因共表达网络并划分模块,选择与临床指标相关的基因模块,用R语言的GeneAnswers包进行GO分析和KEGG通路分析,并结合TRANSFAC数据库进行上游转录因子分析,选择模块的枢纽基因和上游转录因子作为候选重基因.结果 基因共表达网络包括34个模块. Green模块与HbA1C%呈正相关(R＝0.47, P＝1×10－4),GO富集分析结果主为细胞粘附、细胞外基质降解等,KEGG通路为胰腺分泌、粘着斑等. Green模块的枢纽基因有3个,分别为ITGA6、ZAK和YBX3. Brown模块与HbA1C呈负相关(R＝0.46, P＝1×10－4),GO富集分析结果为突触、跨膜转运蛋白活性和运输等,KEGG通路为胰岛素分泌、多巴胺能突触等,上游转录因子PAX6、REST和PDX1可能在疾病中发挥了重作用. Brown模块的枢纽基因包括SLC4A10、ELAVL4、SYT14等30个基因.既往研究示这些基因可能在2型糖尿病的发病机制中起了重作用.结论 通过构建基因共表达网络的方法能够从转录组数据中挖掘到2型糖尿病发病相关的重基因,为疾病研究供新的候选基因和分子机制.
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